艾灸防治瘟疫，古而有之。在历史上，艾灸在防治瘟疫中的作用被历代医家所青睐。在古代艾灸作为防疫措施有两种方法：一是把艾点燃用烟进行空气消毒防疫；二是通过灸强壮穴位增强人体免疫力，以达到未病先防的目的，同时辩证施灸治疗已感疫疾。

艾叶性味芳香，辛散苦燥，为散寒除湿，温经止痛和避秽辟邪之要品，是我国古代用于预防瘟疫的重要药物。晋代葛洪《肘后备急方》用艾叶烟熏预防瘟疫传染的方法：在瘟疫流行期“以艾灸病人床四角，各一壮，令不相染”。《本草纲目》言“艾叶苦辛，性温，熟热，纯阳之性，能回垂绝之阳，通十二经，走三阴，理气血，逐寒湿，……能透诸经而除百病。”现代研究也表明，艾烟对多种细菌和病毒有抑制和杀灭作用。
熏艾叶的历史至少已有2500多年。上世纪70年代初，考古学家在湖南长沙的马王堆里发现了一个熏药的炉子，经过分析，考古学家认为炉子里面装的都是中药，虽然是什么种类的中药已经无法研究，但可以确定的是，古代人已开始使用中药熏香。而艾叶熏香则早有史书记载，不仅是艾叶，苍术也是可以用来熏的中药。
艾叶、苍术等中药配合，能发挥芳香化湿、辟秽化浊之效。现代医学研究中运用中药材熏蒸进行病房等医院环境进行空气消毒的临床试验证明中药材熏蒸空气消毒的效果明确，在外感流行病多发的季节，可做为一个有效的家庭预防方法。而相关药理研究也证明艾叶、苍术等中药材中的有效成分对细菌、真菌及部分病毒有广泛抑制作用。
艾叶烟熏法：点燃艾条放置于安全的地方，使其自然燃烧释放出艾烟于空气中；一般可持续熏灸30-60分钟，继续密闭1小时，再打开窗通风。建议隔天一次。
艾灸法：强身健体，扶正祛邪。艾灸可调节脏腑功能，促进新陈代谢，提高机体免疫力，增加红细胞、白细胞的数量和增强巨噬细胞的吞噬能力。免疫力下降，防御疾病能力减弱，易于感染，艾灸足三里等穴位达到“正气存内，邪不可干”之目的。
推荐艾灸防疫处方如下：艾灸处方一：每日艾灸中脘、足三里、地机3个穴位；每次每个穴位艾灸10分钟；可以温阳散寒、除湿健脾和胃。
艾灸处方二：艾灸气海、合谷、三阴交3个穴位；每穴10分钟；可提高正气，温通阳气，提高身体免疫力。
附：穴位定位及功效中脘穴位于人体上腹部，前正中线上，当脐中下4寸。具有健脾胃、助运化、调气血、补中气、安神志的作用。

足三里穴位于小腿外侧，犊鼻下3寸，犊鼻与解溪连线上。它具有调理脾胃、补中益气、疏风化湿、扶正祛邪的功能。

地机穴在内踝尖与阴陵泉的连线上，阴陵泉下3寸。地机穴有健脾渗湿，调经止带的功效，它可以治疗腹胀、腹痛、食欲不振等脾胃问题。

合谷穴位于第一、二掌骨间，第二掌骨桡侧的中点处，虎口的位置。合谷穴具有疏风解表、清利头目、通经止痛等作用。

气海穴位于下腹部，前正中线上，脐中下1.5寸。是人体重要的养生保健穴位，它具有补肾固精、温养益气和强壮体质的作用。

三阴交穴位于小腿内侧，当足内踝尖上3寸，是足三阴经的交会穴。三阴交穴对肝、脾、肾三经都有调理的作用。三阴交穴有健脾和胃、渗湿利水、滋补肝肾、安神、调经等作用。